Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpa3Q9CQ71 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpa3Q9CQ71 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpa3Q9CQ71 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpa3Q9CQ71 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpa3Q9CQ71 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpa3Q9CQ71 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpa3Q9CQ71 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpa3Q9CQ71 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpa3Q9CQ71 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpa3Q9CQ71 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpa3Q9CQ71 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpa3Q9CQ71 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpa3Q9CQ71 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpa3Q9CQ71 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpa3Q9CQ71 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpa3Q9CQ71 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpa3Q9CQ71 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpa3Q9CQ71 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpa3Q9CQ71 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpa3Q9CQ71 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpa3Q9CQ71 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpa3Q9CQ71 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpa3Q9CQ71 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpa3Q9CQ71 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpa3Q9CQ71 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpa3Q9CQ71 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpa3Q9CQ71 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpa3Q9CQ71 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpa3Q9CQ71 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpa3Q9CQ71 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpa3Q9CQ71 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpa3Q9CQ71 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpa3Q9CQ71 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpa3Q9CQ71 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpa3Q9CQ71 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpa3Q9CQ71 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpa3Q9CQ71 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpa3Q9CQ71 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpa3Q9CQ71 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpa3Q9CQ71 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpa3Q9CQ71 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpa3Q9CQ71 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpa3Q9CQ71 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpa3Q9CQ71 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpa3Q9CQ71 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpa3Q9CQ71 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpa3Q9CQ71 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpa3Q9CQ71 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpa3Q9CQ71 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpa3Q9CQ71 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpa3Q9CQ71 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpa3Q9CQ71 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpa3Q9CQ71 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpa3Q9CQ71 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpa3Q9CQ71 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpa3Q9CQ71 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpa3Q9CQ71 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpa3Q9CQ71 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms