Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ3

Tomm22, Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm22Q9CPQ3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tomm22Q9CPQ3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tomm22Q9CPQ3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tomm22Q9CPQ3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tomm22Q9CPQ3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tomm22Q9CPQ3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tomm22Q9CPQ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tomm22Q9CPQ3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tomm22Q9CPQ3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tomm22Q9CPQ3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tomm22Q9CPQ3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tomm22Q9CPQ3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tomm22Q9CPQ3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tomm22Q9CPQ3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tomm22Q9CPQ3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tomm22Q9CPQ3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tomm22Q9CPQ3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tomm22Q9CPQ3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tomm22Q9CPQ3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tomm22Q9CPQ3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tomm22Q9CPQ3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tomm22Q9CPQ3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tomm22Q9CPQ3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tomm22Q9CPQ3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tomm22Q9CPQ3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tomm22Q9CPQ3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tomm22Q9CPQ3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tomm22Q9CPQ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tomm22Q9CPQ3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tomm22Q9CPQ3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tomm22Q9CPQ3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tomm22Q9CPQ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tomm22Q9CPQ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tomm22Q9CPQ3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tomm22Q9CPQ3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tomm22Q9CPQ3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tomm22Q9CPQ3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tomm22Q9CPQ3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tomm22Q9CPQ3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tomm22Q9CPQ3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Tomm22Q9CPQ3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tomm22Q9CPQ3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tomm22Q9CPQ3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms