Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bhlhe41Q99PV5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bhlhe41Q99PV5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhe41Q99PV5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhe41Q99PV5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhe41Q99PV5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe41Q99PV5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe41Q99PV5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe41Q99PV5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe41Q99PV5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe41Q99PV5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe41Q99PV5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe41Q99PV5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlhe41Q99PV5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bhlhe41Q99PV5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhe41Q99PV5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe41Q99PV5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhe41Q99PV5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms