Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim8Q99PJ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim8Q99PJ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim8Q99PJ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim8Q99PJ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim8Q99PJ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim8Q99PJ2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim8Q99PJ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim8Q99PJ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim8Q99PJ2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim8Q99PJ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim8Q99PJ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim8Q99PJ2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim8Q99PJ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim8Q99PJ2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim8Q99PJ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim8Q99PJ2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim8Q99PJ2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim8Q99PJ2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim8Q99PJ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim8Q99PJ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim8Q99PJ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim8Q99PJ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim8Q99PJ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim8Q99PJ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim8Q99PJ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim8Q99PJ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim8Q99PJ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim8Q99PJ2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim8Q99PJ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim8Q99PJ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim8Q99PJ2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim8Q99PJ2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim8Q99PJ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim8Q99PJ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim8Q99PJ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim8Q99PJ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim8Q99PJ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim8Q99PJ2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim8Q99PJ2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim8Q99PJ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim8Q99PJ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim8Q99PJ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim8Q99PJ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim8Q99PJ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim8Q99PJ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms