Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl43Q99N89 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mrpl43Q99N89 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mrpl43Q99N89 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mrpl43Q99N89 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mrpl43Q99N89 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mrpl43Q99N89 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mrpl43Q99N89 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mrpl43Q99N89 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mrpl43Q99N89 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrpl43Q99N89 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrpl43Q99N89 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mrpl43Q99N89 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mrpl43Q99N89 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mrpl43Q99N89 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mrpl43Q99N89 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl43Q99N89 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl43Q99N89 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl43Q99N89 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl43Q99N89 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl43Q99N89 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl43Q99N89 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl43Q99N89 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mrpl43Q99N89 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mrpl43Q99N89 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl43Q99N89 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl43Q99N89 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl43Q99N89 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl43Q99N89 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl43Q99N89 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl43Q99N89 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl43Q99N89 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl43Q99N89 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl43Q99N89 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl43Q99N89 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl43Q99N89 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl43Q99N89 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl43Q99N89 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mrpl43Q99N89 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl43Q99N89 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl43Q99N89 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 289 ms