Protein–RNA interactions for Protein: Q99N16

Cyp4f3, Leukotriene-B(4) omega-hydroxylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f3Q99N16 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyp4f3Q99N16 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp4f3Q99N16 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp4f3Q99N16 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp4f3Q99N16 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp4f3Q99N16 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp4f3Q99N16 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp4f3Q99N16 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp4f3Q99N16 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp4f3Q99N16 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp4f3Q99N16 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp4f3Q99N16 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp4f3Q99N16 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp4f3Q99N16 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp4f3Q99N16 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp4f3Q99N16 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp4f3Q99N16 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp4f3Q99N16 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp4f3Q99N16 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp4f3Q99N16 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp4f3Q99N16 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f3Q99N16 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp4f3Q99N16 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp4f3Q99N16 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp4f3Q99N16 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp4f3Q99N16 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp4f3Q99N16 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp4f3Q99N16 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp4f3Q99N16 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp4f3Q99N16 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp4f3Q99N16 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp4f3Q99N16 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp4f3Q99N16 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp4f3Q99N16 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp4f3Q99N16 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp4f3Q99N16 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp4f3Q99N16 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp4f3Q99N16 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp4f3Q99N16 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp4f3Q99N16 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp4f3Q99N16 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp4f3Q99N16 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp4f3Q99N16 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp4f3Q99N16 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp4f3Q99N16 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms