Protein–RNA interactions for Protein: Q99M74

Krt82, Keratin, type II cuticular Hb2, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt82Q99M74 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt82Q99M74 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt82Q99M74 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt82Q99M74 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt82Q99M74 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt82Q99M74 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt82Q99M74 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt82Q99M74 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Krt82Q99M74 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt82Q99M74 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt82Q99M74 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt82Q99M74 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt82Q99M74 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt82Q99M74 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt82Q99M74 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt82Q99M74 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt82Q99M74 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt82Q99M74 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Krt82Q99M74 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt82Q99M74 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt82Q99M74 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt82Q99M74 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt82Q99M74 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt82Q99M74 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt82Q99M74 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt82Q99M74 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt82Q99M74 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt82Q99M74 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt82Q99M74 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt82Q99M74 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt82Q99M74 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt82Q99M74 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt82Q99M74 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt82Q99M74 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt82Q99M74 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt82Q99M74 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt82Q99M74 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt82Q99M74 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt82Q99M74 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt82Q99M74 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt82Q99M74 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt82Q99M74 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Krt82Q99M74 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Krt82Q99M74 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Krt82Q99M74 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Krt82Q99M74 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms