Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gps1Q99LD4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gps1Q99LD4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gps1Q99LD4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gps1Q99LD4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gps1Q99LD4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gps1Q99LD4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gps1Q99LD4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gps1Q99LD4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gps1Q99LD4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gps1Q99LD4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gps1Q99LD4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gps1Q99LD4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gps1Q99LD4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gps1Q99LD4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gps1Q99LD4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gps1Q99LD4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gps1Q99LD4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gps1Q99LD4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gps1Q99LD4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gps1Q99LD4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gps1Q99LD4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gps1Q99LD4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gps1Q99LD4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gps1Q99LD4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gps1Q99LD4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gps1Q99LD4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gps1Q99LD4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gps1Q99LD4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gps1Q99LD4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gps1Q99LD4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gps1Q99LD4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gps1Q99LD4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gps1Q99LD4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gps1Q99LD4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gps1Q99LD4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gps1Q99LD4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gps1Q99LD4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gps1Q99LD4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gps1Q99LD4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gps1Q99LD4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gps1Q99LD4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gps1Q99LD4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gps1Q99LD4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gps1Q99LD4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gps1Q99LD4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gps1Q99LD4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gps1Q99LD4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gps1Q99LD4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gps1Q99LD4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gps1Q99LD4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gps1Q99LD4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gps1Q99LD4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gps1Q99LD4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gps1Q99LD4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gps1Q99LD4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gps1Q99LD4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gps1Q99LD4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gps1Q99LD4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gps1Q99LD4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gps1Q99LD4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gps1Q99LD4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gps1Q99LD4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gps1Q99LD4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gps1Q99LD4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gps1Q99LD4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gps1Q99LD4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gps1Q99LD4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gps1Q99LD4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gps1Q99LD4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gps1Q99LD4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gps1Q99LD4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gps1Q99LD4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gps1Q99LD4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms