Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NgrnQ99KS2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgrnQ99KS2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NgrnQ99KS2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NgrnQ99KS2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NgrnQ99KS2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NgrnQ99KS2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NgrnQ99KS2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NgrnQ99KS2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NgrnQ99KS2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NgrnQ99KS2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NgrnQ99KS2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NgrnQ99KS2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NgrnQ99KS2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NgrnQ99KS2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NgrnQ99KS2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NgrnQ99KS2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NgrnQ99KS2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NgrnQ99KS2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NgrnQ99KS2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NgrnQ99KS2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NgrnQ99KS2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NgrnQ99KS2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NgrnQ99KS2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NgrnQ99KS2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NgrnQ99KS2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NgrnQ99KS2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms