Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ophn1Q99J31 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ophn1Q99J31 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ophn1Q99J31 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ophn1Q99J31 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ophn1Q99J31 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ophn1Q99J31 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ophn1Q99J31 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ophn1Q99J31 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ophn1Q99J31 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ophn1Q99J31 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ophn1Q99J31 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ophn1Q99J31 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ophn1Q99J31 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ophn1Q99J31 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ophn1Q99J31 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ophn1Q99J31 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ophn1Q99J31 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ophn1Q99J31 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ophn1Q99J31 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ophn1Q99J31 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ophn1Q99J31 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ophn1Q99J31 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ophn1Q99J31 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ophn1Q99J31 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms