Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smim11aQ99J19 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smim11aQ99J19 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smim11aQ99J19 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smim11aQ99J19 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smim11aQ99J19 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smim11aQ99J19 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smim11aQ99J19 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smim11aQ99J19 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smim11aQ99J19 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smim11aQ99J19 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smim11aQ99J19 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smim11aQ99J19 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smim11aQ99J19 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smim11aQ99J19 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smim11aQ99J19 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smim11aQ99J19 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smim11aQ99J19 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smim11aQ99J19 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smim11aQ99J19 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smim11aQ99J19 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smim11aQ99J19 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smim11aQ99J19 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smim11aQ99J19 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smim11aQ99J19 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smim11aQ99J19 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smim11aQ99J19 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smim11aQ99J19 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smim11aQ99J19 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smim11aQ99J19 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smim11aQ99J19 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smim11aQ99J19 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smim11aQ99J19 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smim11aQ99J19 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smim11aQ99J19 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smim11aQ99J19 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smim11aQ99J19 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smim11aQ99J19 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smim11aQ99J19 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smim11aQ99J19 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smim11aQ99J19 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smim11aQ99J19 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smim11aQ99J19 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smim11aQ99J19 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smim11aQ99J19 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smim11aQ99J19 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smim11aQ99J19 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smim11aQ99J19 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smim11aQ99J19 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smim11aQ99J19 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smim11aQ99J19 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smim11aQ99J19 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smim11aQ99J19 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smim11aQ99J19 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smim11aQ99J19 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smim11aQ99J19 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smim11aQ99J19 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smim11aQ99J19 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smim11aQ99J19 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smim11aQ99J19 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smim11aQ99J19 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms