Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim7Q923T7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim7Q923T7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim7Q923T7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim7Q923T7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim7Q923T7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim7Q923T7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim7Q923T7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim7Q923T7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim7Q923T7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim7Q923T7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim7Q923T7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim7Q923T7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim7Q923T7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim7Q923T7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim7Q923T7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim7Q923T7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim7Q923T7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim7Q923T7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim7Q923T7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim7Q923T7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim7Q923T7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim7Q923T7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim7Q923T7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim7Q923T7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim7Q923T7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim7Q923T7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim7Q923T7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms