Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf3Q920N1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Odf3Q920N1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf3Q920N1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Odf3Q920N1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms