Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Supt16hQ920B9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Supt16hQ920B9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Supt16hQ920B9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Supt16hQ920B9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Supt16hQ920B9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Supt16hQ920B9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Supt16hQ920B9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Supt16hQ920B9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Supt16hQ920B9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Supt16hQ920B9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Supt16hQ920B9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Supt16hQ920B9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Supt16hQ920B9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Supt16hQ920B9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Supt16hQ920B9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Supt16hQ920B9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Supt16hQ920B9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Supt16hQ920B9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Supt16hQ920B9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Supt16hQ920B9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Supt16hQ920B9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Supt16hQ920B9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Supt16hQ920B9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Supt16hQ920B9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Supt16hQ920B9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
Supt16hQ920B9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Supt16hQ920B9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Supt16hQ920B9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Supt16hQ920B9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Supt16hQ920B9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Supt16hQ920B9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Supt16hQ920B9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Supt16hQ920B9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Supt16hQ920B9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Supt16hQ920B9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Supt16hQ920B9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Supt16hQ920B9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Supt16hQ920B9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Supt16hQ920B9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Supt16hQ920B9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Supt16hQ920B9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Supt16hQ920B9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Supt16hQ920B9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Supt16hQ920B9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Supt16hQ920B9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Supt16hQ920B9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Supt16hQ920B9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Supt16hQ920B9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Supt16hQ920B9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Supt16hQ920B9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Supt16hQ920B9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Supt16hQ920B9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Supt16hQ920B9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Supt16hQ920B9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Supt16hQ920B9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Supt16hQ920B9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.41
Supt16hQ920B9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Supt16hQ920B9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Supt16hQ920B9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Supt16hQ920B9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Supt16hQ920B9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Supt16hQ920B9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Supt16hQ920B9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Supt16hQ920B9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Supt16hQ920B9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms