Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha8Q91Y12 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdha8Q91Y12 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha8Q91Y12 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha8Q91Y12 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha8Q91Y12 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha8Q91Y12 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha8Q91Y12 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha8Q91Y12 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha8Q91Y12 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha8Q91Y12 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha8Q91Y12 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha8Q91Y12 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha8Q91Y12 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha8Q91Y12 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha8Q91Y12 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha8Q91Y12 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha8Q91Y12 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha8Q91Y12 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha8Q91Y12 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha8Q91Y12 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha8Q91Y12 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha8Q91Y12 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha8Q91Y12 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha8Q91Y12 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha8Q91Y12 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha8Q91Y12 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha8Q91Y12 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha8Q91Y12 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdha8Q91Y12 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdha8Q91Y12 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha8Q91Y12 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha8Q91Y12 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha8Q91Y12 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha8Q91Y12 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha8Q91Y12 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha8Q91Y12 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha8Q91Y12 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha8Q91Y12 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha8Q91Y12 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha8Q91Y12 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha8Q91Y12 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms