Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC1

Hpgd, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpgdQ8VCC1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HpgdQ8VCC1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HpgdQ8VCC1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HpgdQ8VCC1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HpgdQ8VCC1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HpgdQ8VCC1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HpgdQ8VCC1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HpgdQ8VCC1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HpgdQ8VCC1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HpgdQ8VCC1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HpgdQ8VCC1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HpgdQ8VCC1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HpgdQ8VCC1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HpgdQ8VCC1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HpgdQ8VCC1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HpgdQ8VCC1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HpgdQ8VCC1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HpgdQ8VCC1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HpgdQ8VCC1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HpgdQ8VCC1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HpgdQ8VCC1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HpgdQ8VCC1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HpgdQ8VCC1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HpgdQ8VCC1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HpgdQ8VCC1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HpgdQ8VCC1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HpgdQ8VCC1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms