Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf3c5Q8R2T8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf3c5Q8R2T8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf3c5Q8R2T8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtf3c5Q8R2T8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtf3c5Q8R2T8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtf3c5Q8R2T8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtf3c5Q8R2T8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtf3c5Q8R2T8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtf3c5Q8R2T8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtf3c5Q8R2T8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Gtf3c5Q8R2T8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtf3c5Q8R2T8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtf3c5Q8R2T8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtf3c5Q8R2T8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf3c5Q8R2T8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf3c5Q8R2T8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gtf3c5Q8R2T8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf3c5Q8R2T8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf3c5Q8R2T8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf3c5Q8R2T8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf3c5Q8R2T8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf3c5Q8R2T8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtf3c5Q8R2T8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtf3c5Q8R2T8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gtf3c5Q8R2T8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gtf3c5Q8R2T8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gtf3c5Q8R2T8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf3c5Q8R2T8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtf3c5Q8R2T8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtf3c5Q8R2T8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtf3c5Q8R2T8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gtf3c5Q8R2T8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gtf3c5Q8R2T8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtf3c5Q8R2T8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtf3c5Q8R2T8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf3c5Q8R2T8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf3c5Q8R2T8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf3c5Q8R2T8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf3c5Q8R2T8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf3c5Q8R2T8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf3c5Q8R2T8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf3c5Q8R2T8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gtf3c5Q8R2T8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gtf3c5Q8R2T8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gtf3c5Q8R2T8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf3c5Q8R2T8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf3c5Q8R2T8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gtf3c5Q8R2T8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gtf3c5Q8R2T8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gtf3c5Q8R2T8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf3c5Q8R2T8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf3c5Q8R2T8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf3c5Q8R2T8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtf3c5Q8R2T8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtf3c5Q8R2T8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtf3c5Q8R2T8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtf3c5Q8R2T8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf3c5Q8R2T8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf3c5Q8R2T8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf3c5Q8R2T8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gtf3c5Q8R2T8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gtf3c5Q8R2T8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gtf3c5Q8R2T8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Gtf3c5Q8R2T8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gtf3c5Q8R2T8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gtf3c5Q8R2T8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf3c5Q8R2T8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf3c5Q8R2T8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf3c5Q8R2T8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf3c5Q8R2T8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf3c5Q8R2T8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf3c5Q8R2T8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms