Protein–RNA interactions for Protein: Q8K596

Slc8a2, Sodium/calcium exchanger 2, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a2Q8K596 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc8a2Q8K596 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc8a2Q8K596 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc8a2Q8K596 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc8a2Q8K596 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc8a2Q8K596 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc8a2Q8K596 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc8a2Q8K596 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc8a2Q8K596 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc8a2Q8K596 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc8a2Q8K596 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc8a2Q8K596 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc8a2Q8K596 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc8a2Q8K596 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc8a2Q8K596 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc8a2Q8K596 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc8a2Q8K596 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc8a2Q8K596 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc8a2Q8K596 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc8a2Q8K596 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc8a2Q8K596 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc8a2Q8K596 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc8a2Q8K596 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc8a2Q8K596 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc8a2Q8K596 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc8a2Q8K596 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc8a2Q8K596 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc8a2Q8K596 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc8a2Q8K596 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc8a2Q8K596 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc8a2Q8K596 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc8a2Q8K596 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc8a2Q8K596 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc8a2Q8K596 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc8a2Q8K596 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc8a2Q8K596 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc8a2Q8K596 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc8a2Q8K596 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc8a2Q8K596 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc8a2Q8K596 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc8a2Q8K596 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc8a2Q8K596 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc8a2Q8K596 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc8a2Q8K596 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc8a2Q8K596 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc8a2Q8K596 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc8a2Q8K596 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc8a2Q8K596 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc8a2Q8K596 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc8a2Q8K596 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc8a2Q8K596 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc8a2Q8K596 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc8a2Q8K596 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc8a2Q8K596 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc8a2Q8K596 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc8a2Q8K596 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc8a2Q8K596 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms