Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q0

Rptor, Regulatory-associated protein of mTOR, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptorQ8K4Q0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RptorQ8K4Q0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RptorQ8K4Q0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RptorQ8K4Q0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RptorQ8K4Q0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RptorQ8K4Q0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RptorQ8K4Q0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RptorQ8K4Q0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RptorQ8K4Q0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RptorQ8K4Q0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RptorQ8K4Q0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RptorQ8K4Q0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RptorQ8K4Q0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RptorQ8K4Q0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RptorQ8K4Q0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RptorQ8K4Q0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RptorQ8K4Q0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RptorQ8K4Q0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RptorQ8K4Q0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RptorQ8K4Q0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RptorQ8K4Q0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RptorQ8K4Q0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RptorQ8K4Q0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RptorQ8K4Q0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RptorQ8K4Q0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RptorQ8K4Q0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RptorQ8K4Q0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RptorQ8K4Q0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RptorQ8K4Q0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RptorQ8K4Q0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RptorQ8K4Q0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RptorQ8K4Q0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RptorQ8K4Q0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RptorQ8K4Q0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RptorQ8K4Q0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RptorQ8K4Q0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RptorQ8K4Q0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RptorQ8K4Q0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RptorQ8K4Q0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RptorQ8K4Q0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RptorQ8K4Q0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RptorQ8K4Q0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RptorQ8K4Q0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RptorQ8K4Q0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RptorQ8K4Q0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RptorQ8K4Q0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RptorQ8K4Q0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RptorQ8K4Q0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RptorQ8K4Q0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RptorQ8K4Q0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RptorQ8K4Q0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RptorQ8K4Q0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RptorQ8K4Q0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RptorQ8K4Q0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RptorQ8K4Q0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RptorQ8K4Q0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RptorQ8K4Q0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RptorQ8K4Q0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms