Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdh16f2Q8K3M1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdh16f2Q8K3M1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdh16f2Q8K3M1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdh16f2Q8K3M1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdh16f2Q8K3M1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rdh16f2Q8K3M1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdh16f2Q8K3M1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh16f2Q8K3M1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh16f2Q8K3M1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh16f2Q8K3M1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh16f2Q8K3M1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh16f2Q8K3M1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh16f2Q8K3M1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh16f2Q8K3M1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh16f2Q8K3M1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh16f2Q8K3M1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rdh16f2Q8K3M1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh16f2Q8K3M1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdh16f2Q8K3M1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms