Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F8

Lsm14a, Protein LSM14 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm14aQ8K2F8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm14aQ8K2F8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lsm14aQ8K2F8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsm14aQ8K2F8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsm14aQ8K2F8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lsm14aQ8K2F8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lsm14aQ8K2F8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lsm14aQ8K2F8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lsm14aQ8K2F8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lsm14aQ8K2F8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsm14aQ8K2F8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsm14aQ8K2F8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsm14aQ8K2F8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms