Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ClasrpQ8CFC7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ClasrpQ8CFC7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ClasrpQ8CFC7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ClasrpQ8CFC7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ClasrpQ8CFC7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ClasrpQ8CFC7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ClasrpQ8CFC7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ClasrpQ8CFC7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ClasrpQ8CFC7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ClasrpQ8CFC7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ClasrpQ8CFC7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ClasrpQ8CFC7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ClasrpQ8CFC7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ClasrpQ8CFC7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ClasrpQ8CFC7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ClasrpQ8CFC7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ClasrpQ8CFC7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ClasrpQ8CFC7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ClasrpQ8CFC7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ClasrpQ8CFC7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ClasrpQ8CFC7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ClasrpQ8CFC7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ClasrpQ8CFC7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ClasrpQ8CFC7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ClasrpQ8CFC7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ClasrpQ8CFC7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ClasrpQ8CFC7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ClasrpQ8CFC7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ClasrpQ8CFC7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ClasrpQ8CFC7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ClasrpQ8CFC7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ClasrpQ8CFC7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClasrpQ8CFC7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClasrpQ8CFC7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClasrpQ8CFC7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClasrpQ8CFC7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClasrpQ8CFC7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ClasrpQ8CFC7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ClasrpQ8CFC7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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