Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN1

Uncharacterized protein C3orf20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 933 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDN1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q8CDN1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q8CDN1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q8CDN1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q8CDN1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q8CDN1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Q8CDN1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q8CDN1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Q8CDN1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Q8CDN1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q8CDN1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q8CDN1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q8CDN1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q8CDN1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q8CDN1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q8CDN1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q8CDN1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q8CDN1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q8CDN1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q8CDN1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q8CDN1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q8CDN1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8CDN1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8CDN1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8CDN1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8CDN1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Q8CDN1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q8CDN1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q8CDN1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Q8CDN1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q8CDN1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Q8CDN1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q8CDN1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Q8CDN1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q8CDN1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8CDN1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8CDN1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8CDN1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8CDN1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8CDN1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8CDN1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8CDN1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8CDN1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8CDN1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8CDN1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Q8CDN1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q8CDN1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q8CDN1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q8CDN1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8CDN1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8CDN1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8CDN1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8CDN1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8CDN1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q8CDN1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8CDN1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8CDN1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8CDN1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8CDN1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8CDN1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8CDN1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8CDN1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8CDN1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8CDN1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8CDN1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8CDN1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8CDN1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8CDN1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8CDN1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8CDN1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8CDN1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8CDN1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8CDN1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8CDN1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8CDN1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8CDN1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q8CDN1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8CDN1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8CDN1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q8CDN1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q8CDN1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Q8CDN1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q8CDN1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q8CDN1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q8CDN1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q8CDN1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q8CDN1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q8CDN1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q8CDN1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8CDN1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8CDN1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8CDN1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q8CDN1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q8CDN1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q8CDN1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q8CDN1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q8CDN1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q8CDN1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q8CDN1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q8CDN1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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