Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tsr2Q8C8T8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tsr2Q8C8T8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tsr2Q8C8T8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tsr2Q8C8T8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tsr2Q8C8T8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tsr2Q8C8T8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tsr2Q8C8T8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tsr2Q8C8T8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tsr2Q8C8T8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tsr2Q8C8T8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tsr2Q8C8T8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tsr2Q8C8T8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tsr2Q8C8T8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tsr2Q8C8T8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tsr2Q8C8T8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tsr2Q8C8T8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tsr2Q8C8T8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Tsr2Q8C8T8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tsr2Q8C8T8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tsr2Q8C8T8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tsr2Q8C8T8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tsr2Q8C8T8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tsr2Q8C8T8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tsr2Q8C8T8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tsr2Q8C8T8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tsr2Q8C8T8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tsr2Q8C8T8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tsr2Q8C8T8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tsr2Q8C8T8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tsr2Q8C8T8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tsr2Q8C8T8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tsr2Q8C8T8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tsr2Q8C8T8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tsr2Q8C8T8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tsr2Q8C8T8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tsr2Q8C8T8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tsr2Q8C8T8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tsr2Q8C8T8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tsr2Q8C8T8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tsr2Q8C8T8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tsr2Q8C8T8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tsr2Q8C8T8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tsr2Q8C8T8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tsr2Q8C8T8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tsr2Q8C8T8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tsr2Q8C8T8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tsr2Q8C8T8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tsr2Q8C8T8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tsr2Q8C8T8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tsr2Q8C8T8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tsr2Q8C8T8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tsr2Q8C8T8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tsr2Q8C8T8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tsr2Q8C8T8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tsr2Q8C8T8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tsr2Q8C8T8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tsr2Q8C8T8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tsr2Q8C8T8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tsr2Q8C8T8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tsr2Q8C8T8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tsr2Q8C8T8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tsr2Q8C8T8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tsr2Q8C8T8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tsr2Q8C8T8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tsr2Q8C8T8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms