Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dclre1bQ8C7W7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dclre1bQ8C7W7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Dclre1bQ8C7W7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dclre1bQ8C7W7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dclre1bQ8C7W7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dclre1bQ8C7W7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dclre1bQ8C7W7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dclre1bQ8C7W7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dclre1bQ8C7W7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dclre1bQ8C7W7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dclre1bQ8C7W7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dclre1bQ8C7W7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dclre1bQ8C7W7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dclre1bQ8C7W7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dclre1bQ8C7W7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dclre1bQ8C7W7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dclre1bQ8C7W7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dclre1bQ8C7W7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dclre1bQ8C7W7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dclre1bQ8C7W7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dclre1bQ8C7W7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dclre1bQ8C7W7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dclre1bQ8C7W7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dclre1bQ8C7W7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dclre1bQ8C7W7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dclre1bQ8C7W7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms