Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6U2

Pqlc3, PQ-loop repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pqlc3Q8C6U2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pqlc3Q8C6U2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pqlc3Q8C6U2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pqlc3Q8C6U2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pqlc3Q8C6U2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pqlc3Q8C6U2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pqlc3Q8C6U2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pqlc3Q8C6U2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pqlc3Q8C6U2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pqlc3Q8C6U2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pqlc3Q8C6U2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pqlc3Q8C6U2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pqlc3Q8C6U2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pqlc3Q8C6U2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pqlc3Q8C6U2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pqlc3Q8C6U2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pqlc3Q8C6U2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pqlc3Q8C6U2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pqlc3Q8C6U2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms