Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apol7cQ8C6E1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol7cQ8C6E1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol7cQ8C6E1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apol7cQ8C6E1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apol7cQ8C6E1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apol7cQ8C6E1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol7cQ8C6E1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol7cQ8C6E1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol7cQ8C6E1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apol7cQ8C6E1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apol7cQ8C6E1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apol7cQ8C6E1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol7cQ8C6E1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol7cQ8C6E1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apol7cQ8C6E1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apol7cQ8C6E1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apol7cQ8C6E1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apol7cQ8C6E1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apol7cQ8C6E1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apol7cQ8C6E1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apol7cQ8C6E1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apol7cQ8C6E1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apol7cQ8C6E1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol7cQ8C6E1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol7cQ8C6E1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol7cQ8C6E1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apol7cQ8C6E1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apol7cQ8C6E1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apol7cQ8C6E1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apol7cQ8C6E1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apol7cQ8C6E1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apol7cQ8C6E1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol7cQ8C6E1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol7cQ8C6E1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol7cQ8C6E1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol7cQ8C6E1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol7cQ8C6E1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol7cQ8C6E1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol7cQ8C6E1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol7cQ8C6E1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apol7cQ8C6E1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apol7cQ8C6E1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apol7cQ8C6E1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Apol7cQ8C6E1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apol7cQ8C6E1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms