Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y2

Gm9999, Predicted gene 9999, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9999Q8C5Y2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm9999Q8C5Y2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm9999Q8C5Y2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm9999Q8C5Y2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm9999Q8C5Y2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm9999Q8C5Y2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm9999Q8C5Y2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm9999Q8C5Y2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm9999Q8C5Y2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm9999Q8C5Y2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm9999Q8C5Y2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm9999Q8C5Y2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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