Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8C1R3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8C1R3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8C1R3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8C1R3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8C1R3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8C1R3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8C1R3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8C1R3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8C1R3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q8C1R3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q8C1R3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Q8C1R3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q8C1R3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q8C1R3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q8C1R3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q8C1R3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8C1R3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8C1R3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8C1R3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8C1R3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8C1R3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q8C1R3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q8C1R3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q8C1R3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q8C1R3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8C1R3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8C1R3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
Q8C1R3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8C1R3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q8C1R3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q8C1R3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q8C1R3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8C1R3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8C1R3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8C1R3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q8C1R3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q8C1R3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q8C1R3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q8C1R3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q8C1R3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q8C1R3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q8C1R3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q8C1R3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q8C1R3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8C1R3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q8C1R3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q8C1R3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8C1R3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q8C1R3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms