Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ8

Sp8, Transcription factor Sp8, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp8Q8BMJ8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sp8Q8BMJ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sp8Q8BMJ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sp8Q8BMJ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sp8Q8BMJ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sp8Q8BMJ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sp8Q8BMJ8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sp8Q8BMJ8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sp8Q8BMJ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sp8Q8BMJ8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sp8Q8BMJ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sp8Q8BMJ8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sp8Q8BMJ8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sp8Q8BMJ8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Sp8Q8BMJ8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sp8Q8BMJ8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Sp8Q8BMJ8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sp8Q8BMJ8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Sp8Q8BMJ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sp8Q8BMJ8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sp8Q8BMJ8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sp8Q8BMJ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sp8Q8BMJ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sp8Q8BMJ8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Sp8Q8BMJ8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sp8Q8BMJ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sp8Q8BMJ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sp8Q8BMJ8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sp8Q8BMJ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sp8Q8BMJ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sp8Q8BMJ8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sp8Q8BMJ8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sp8Q8BMJ8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sp8Q8BMJ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sp8Q8BMJ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sp8Q8BMJ8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sp8Q8BMJ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sp8Q8BMJ8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sp8Q8BMJ8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sp8Q8BMJ8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sp8Q8BMJ8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sp8Q8BMJ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sp8Q8BMJ8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sp8Q8BMJ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sp8Q8BMJ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sp8Q8BMJ8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sp8Q8BMJ8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sp8Q8BMJ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sp8Q8BMJ8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sp8Q8BMJ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sp8Q8BMJ8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sp8Q8BMJ8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sp8Q8BMJ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sp8Q8BMJ8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sp8Q8BMJ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sp8Q8BMJ8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sp8Q8BMJ8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sp8Q8BMJ8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Sp8Q8BMJ8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sp8Q8BMJ8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sp8Q8BMJ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sp8Q8BMJ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sp8Q8BMJ8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sp8Q8BMJ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sp8Q8BMJ8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sp8Q8BMJ8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sp8Q8BMJ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sp8Q8BMJ8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sp8Q8BMJ8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sp8Q8BMJ8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sp8Q8BMJ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sp8Q8BMJ8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sp8Q8BMJ8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sp8Q8BMJ8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sp8Q8BMJ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sp8Q8BMJ8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sp8Q8BMJ8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sp8Q8BMJ8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sp8Q8BMJ8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sp8Q8BMJ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sp8Q8BMJ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sp8Q8BMJ8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sp8Q8BMJ8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms