Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gpc2Q8BKV1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gpc2Q8BKV1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gpc2Q8BKV1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gpc2Q8BKV1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gpc2Q8BKV1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Gpc2Q8BKV1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gpc2Q8BKV1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gpc2Q8BKV1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gpc2Q8BKV1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gpc2Q8BKV1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gpc2Q8BKV1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gpc2Q8BKV1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gpc2Q8BKV1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gpc2Q8BKV1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gpc2Q8BKV1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gpc2Q8BKV1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gpc2Q8BKV1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gpc2Q8BKV1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gpc2Q8BKV1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gpc2Q8BKV1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gpc2Q8BKV1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gpc2Q8BKV1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gpc2Q8BKV1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gpc2Q8BKV1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gpc2Q8BKV1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gpc2Q8BKV1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gpc2Q8BKV1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gpc2Q8BKV1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gpc2Q8BKV1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gpc2Q8BKV1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gpc2Q8BKV1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gpc2Q8BKV1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gpc2Q8BKV1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gpc2Q8BKV1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gpc2Q8BKV1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gpc2Q8BKV1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gpc2Q8BKV1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gpc2Q8BKV1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gpc2Q8BKV1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gpc2Q8BKV1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gpc2Q8BKV1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gpc2Q8BKV1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gpc2Q8BKV1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gpc2Q8BKV1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gpc2Q8BKV1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gpc2Q8BKV1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gpc2Q8BKV1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gpc2Q8BKV1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gpc2Q8BKV1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms