Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
Gpc2Q8BKV1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Gpc2Q8BKV1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Gpc2Q8BKV1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Gpc2Q8BKV1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Gpc2Q8BKV1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Gpc2Q8BKV1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Gpc2Q8BKV1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Gpc2Q8BKV1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Gpc2Q8BKV1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Gpc2Q8BKV1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Gpc2Q8BKV1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Gpc2Q8BKV1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Gpc2Q8BKV1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Gpc2Q8BKV1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Gpc2Q8BKV1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Gpc2Q8BKV1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Gpc2Q8BKV1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Gpc2Q8BKV1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Gpc2Q8BKV1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Gpc2Q8BKV1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Gpc2Q8BKV1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Gpc2Q8BKV1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Gpc2Q8BKV1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Gpc2Q8BKV1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Gpc2Q8BKV1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Gpc2Q8BKV1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Gpc2Q8BKV1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Gpc2Q8BKV1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Gpc2Q8BKV1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Gpc2Q8BKV1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Gpc2Q8BKV1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gpc2Q8BKV1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gpc2Q8BKV1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Gpc2Q8BKV1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Gpc2Q8BKV1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Gpc2Q8BKV1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Gpc2Q8BKV1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Gpc2Q8BKV1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Gpc2Q8BKV1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Gpc2Q8BKV1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Gpc2Q8BKV1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Gpc2Q8BKV1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Gpc2Q8BKV1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Gpc2Q8BKV1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Gpc2Q8BKV1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Gpc2Q8BKV1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Gpc2Q8BKV1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Gpc2Q8BKV1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Gpc2Q8BKV1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Gpc2Q8BKV1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Gpc2Q8BKV1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gpc2Q8BKV1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gpc2Q8BKV1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gpc2Q8BKV1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Gpc2Q8BKV1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Gpc2Q8BKV1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gpc2Q8BKV1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Gpc2Q8BKV1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Gpc2Q8BKV1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Gpc2Q8BKV1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Gpc2Q8BKV1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Gpc2Q8BKV1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gpc2Q8BKV1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Gpc2Q8BKV1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Gpc2Q8BKV1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gpc2Q8BKV1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Gpc2Q8BKV1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Gpc2Q8BKV1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gpc2Q8BKV1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gpc2Q8BKV1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gpc2Q8BKV1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gpc2Q8BKV1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Gpc2Q8BKV1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Gpc2Q8BKV1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Gpc2Q8BKV1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Gpc2Q8BKV1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Gpc2Q8BKV1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Gpc2Q8BKV1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Gpc2Q8BKV1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Gpc2Q8BKV1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Gpc2Q8BKV1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Gpc2Q8BKV1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Gpc2Q8BKV1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Gpc2Q8BKV1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Gpc2Q8BKV1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Gpc2Q8BKV1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Gpc2Q8BKV1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gpc2Q8BKV1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Gpc2Q8BKV1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gpc2Q8BKV1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Gpc2Q8BKV1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Gpc2Q8BKV1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Gpc2Q8BKV1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gpc2Q8BKV1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Gpc2Q8BKV1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Gpc2Q8BKV1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gpc2Q8BKV1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms