Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJA3

Hmbox1, Homeobox-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmbox1Q8BJA3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmbox1Q8BJA3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmbox1Q8BJA3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmbox1Q8BJA3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmbox1Q8BJA3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmbox1Q8BJA3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmbox1Q8BJA3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmbox1Q8BJA3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmbox1Q8BJA3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmbox1Q8BJA3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmbox1Q8BJA3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmbox1Q8BJA3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmbox1Q8BJA3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmbox1Q8BJA3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmbox1Q8BJA3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmbox1Q8BJA3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmbox1Q8BJA3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmbox1Q8BJA3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmbox1Q8BJA3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmbox1Q8BJA3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hmbox1Q8BJA3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmbox1Q8BJA3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmbox1Q8BJA3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmbox1Q8BJA3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmbox1Q8BJA3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmbox1Q8BJA3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmbox1Q8BJA3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmbox1Q8BJA3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmbox1Q8BJA3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmbox1Q8BJA3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmbox1Q8BJA3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmbox1Q8BJA3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmbox1Q8BJA3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmbox1Q8BJA3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmbox1Q8BJA3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmbox1Q8BJA3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmbox1Q8BJA3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmbox1Q8BJA3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmbox1Q8BJA3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmbox1Q8BJA3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmbox1Q8BJA3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmbox1Q8BJA3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmbox1Q8BJA3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmbox1Q8BJA3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmbox1Q8BJA3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmbox1Q8BJA3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmbox1Q8BJA3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmbox1Q8BJA3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmbox1Q8BJA3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmbox1Q8BJA3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmbox1Q8BJA3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms