Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIA3

Mkx, Homeobox protein Mohawk, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkxQ8BIA3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MkxQ8BIA3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MkxQ8BIA3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MkxQ8BIA3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MkxQ8BIA3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MkxQ8BIA3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MkxQ8BIA3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MkxQ8BIA3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MkxQ8BIA3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MkxQ8BIA3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MkxQ8BIA3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MkxQ8BIA3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MkxQ8BIA3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MkxQ8BIA3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MkxQ8BIA3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MkxQ8BIA3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MkxQ8BIA3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MkxQ8BIA3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MkxQ8BIA3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MkxQ8BIA3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MkxQ8BIA3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MkxQ8BIA3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms