Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH66

Atl1, Atlastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl1Q8BH66 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl1Q8BH66 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl1Q8BH66 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl1Q8BH66 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl1Q8BH66 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atl1Q8BH66 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atl1Q8BH66 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atl1Q8BH66 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atl1Q8BH66 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl1Q8BH66 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl1Q8BH66 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atl1Q8BH66 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atl1Q8BH66 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atl1Q8BH66 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atl1Q8BH66 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atl1Q8BH66 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atl1Q8BH66 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atl1Q8BH66 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atl1Q8BH66 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atl1Q8BH66 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atl1Q8BH66 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atl1Q8BH66 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atl1Q8BH66 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atl1Q8BH66 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atl1Q8BH66 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atl1Q8BH66 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atl1Q8BH66 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atl1Q8BH66 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atl1Q8BH66 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atl1Q8BH66 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atl1Q8BH66 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atl1Q8BH66 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atl1Q8BH66 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atl1Q8BH66 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atl1Q8BH66 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atl1Q8BH66 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atl1Q8BH66 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atl1Q8BH66 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atl1Q8BH66 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atl1Q8BH66 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atl1Q8BH66 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms