Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pknox2Q8BG99 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pknox2Q8BG99 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pknox2Q8BG99 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pknox2Q8BG99 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pknox2Q8BG99 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pknox2Q8BG99 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pknox2Q8BG99 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pknox2Q8BG99 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pknox2Q8BG99 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pknox2Q8BG99 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pknox2Q8BG99 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pknox2Q8BG99 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pknox2Q8BG99 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pknox2Q8BG99 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pknox2Q8BG99 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pknox2Q8BG99 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pknox2Q8BG99 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pknox2Q8BG99 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Pknox2Q8BG99 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pknox2Q8BG99 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pknox2Q8BG99 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pknox2Q8BG99 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pknox2Q8BG99 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pknox2Q8BG99 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pknox2Q8BG99 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pknox2Q8BG99 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pknox2Q8BG99 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pknox2Q8BG99 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pknox2Q8BG99 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pknox2Q8BG99 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pknox2Q8BG99 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pknox2Q8BG99 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pknox2Q8BG99 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pknox2Q8BG99 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pknox2Q8BG99 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pknox2Q8BG99 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pknox2Q8BG99 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pknox2Q8BG99 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pknox2Q8BG99 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pknox2Q8BG99 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pknox2Q8BG99 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pknox2Q8BG99 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pknox2Q8BG99 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pknox2Q8BG99 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pknox2Q8BG99 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pknox2Q8BG99 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms