Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bgrl2Q8BG73 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bgrl2Q8BG73 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bgrl2Q8BG73 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bgrl2Q8BG73 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bgrl2Q8BG73 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sh3bgrl2Q8BG73 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bgrl2Q8BG73 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms