Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG07

Pld4, Phospholipase D4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld4Q8BG07 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pld4Q8BG07 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pld4Q8BG07 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pld4Q8BG07 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pld4Q8BG07 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pld4Q8BG07 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pld4Q8BG07 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pld4Q8BG07 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pld4Q8BG07 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pld4Q8BG07 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pld4Q8BG07 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pld4Q8BG07 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pld4Q8BG07 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pld4Q8BG07 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pld4Q8BG07 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pld4Q8BG07 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms