Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pkhd1l1Q80ZA4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkhd1l1Q80ZA4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms