Protein–RNA interactions for Protein: Q80YT3

Cct8l1, Chaperonin-containing TCP1, subunit 8 (theta)-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct8l1Q80YT3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cct8l1Q80YT3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cct8l1Q80YT3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cct8l1Q80YT3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cct8l1Q80YT3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cct8l1Q80YT3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cct8l1Q80YT3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cct8l1Q80YT3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cct8l1Q80YT3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cct8l1Q80YT3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cct8l1Q80YT3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cct8l1Q80YT3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cct8l1Q80YT3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cct8l1Q80YT3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cct8l1Q80YT3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cct8l1Q80YT3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cct8l1Q80YT3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cct8l1Q80YT3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cct8l1Q80YT3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cct8l1Q80YT3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cct8l1Q80YT3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cct8l1Q80YT3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cct8l1Q80YT3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cct8l1Q80YT3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cct8l1Q80YT3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cct8l1Q80YT3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cct8l1Q80YT3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cct8l1Q80YT3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cct8l1Q80YT3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cct8l1Q80YT3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cct8l1Q80YT3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cct8l1Q80YT3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cct8l1Q80YT3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cct8l1Q80YT3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cct8l1Q80YT3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cct8l1Q80YT3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cct8l1Q80YT3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cct8l1Q80YT3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cct8l1Q80YT3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cct8l1Q80YT3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cct8l1Q80YT3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cct8l1Q80YT3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cct8l1Q80YT3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cct8l1Q80YT3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cct8l1Q80YT3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cct8l1Q80YT3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cct8l1Q80YT3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cct8l1Q80YT3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cct8l1Q80YT3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cct8l1Q80YT3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cct8l1Q80YT3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cct8l1Q80YT3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cct8l1Q80YT3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cct8l1Q80YT3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cct8l1Q80YT3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cct8l1Q80YT3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cct8l1Q80YT3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cct8l1Q80YT3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cct8l1Q80YT3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cct8l1Q80YT3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms