Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SnphQ80U23 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SnphQ80U23 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnphQ80U23 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnphQ80U23 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnphQ80U23 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnphQ80U23 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnphQ80U23 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SnphQ80U23 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SnphQ80U23 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SnphQ80U23 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SnphQ80U23 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnphQ80U23 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnphQ80U23 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnphQ80U23 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnphQ80U23 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnphQ80U23 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnphQ80U23 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SnphQ80U23 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SnphQ80U23 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SnphQ80U23 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SnphQ80U23 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SnphQ80U23 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SnphQ80U23 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SnphQ80U23 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SnphQ80U23 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SnphQ80U23 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms