Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdh8Q7TSK3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh8Q7TSK3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh8Q7TSK3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh8Q7TSK3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh8Q7TSK3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh8Q7TSK3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh8Q7TSK3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdh8Q7TSK3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdh8Q7TSK3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdh8Q7TSK3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdh8Q7TSK3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdh8Q7TSK3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdh8Q7TSK3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdh8Q7TSK3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdh8Q7TSK3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdh8Q7TSK3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms