Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf516Q7TSH3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf516Q7TSH3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf516Q7TSH3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf516Q7TSH3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf516Q7TSH3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf516Q7TSH3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf516Q7TSH3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf516Q7TSH3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf516Q7TSH3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf516Q7TSH3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf516Q7TSH3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf516Q7TSH3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf516Q7TSH3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf516Q7TSH3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf516Q7TSH3 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf516Q7TSH3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf516Q7TSH3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf516Q7TSH3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf516Q7TSH3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf516Q7TSH3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf516Q7TSH3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf516Q7TSH3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf516Q7TSH3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf516Q7TSH3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf516Q7TSH3 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf516Q7TSH3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf516Q7TSH3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf516Q7TSH3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf516Q7TSH3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf516Q7TSH3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf516Q7TSH3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf516Q7TSH3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf516Q7TSH3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf516Q7TSH3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Znf516Q7TSH3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf516Q7TSH3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf516Q7TSH3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Znf516Q7TSH3 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Znf516Q7TSH3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Znf516Q7TSH3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf516Q7TSH3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf516Q7TSH3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf516Q7TSH3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf516Q7TSH3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf516Q7TSH3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf516Q7TSH3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf516Q7TSH3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf516Q7TSH3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf516Q7TSH3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf516Q7TSH3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf516Q7TSH3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms