Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Actn1Q7TPR4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Actn1Q7TPR4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Actn1Q7TPR4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Actn1Q7TPR4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Actn1Q7TPR4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Actn1Q7TPR4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Actn1Q7TPR4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Actn1Q7TPR4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Actn1Q7TPR4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Actn1Q7TPR4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Actn1Q7TPR4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Actn1Q7TPR4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Actn1Q7TPR4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Actn1Q7TPR4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Actn1Q7TPR4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Actn1Q7TPR4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Actn1Q7TPR4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Actn1Q7TPR4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Actn1Q7TPR4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Actn1Q7TPR4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Actn1Q7TPR4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Actn1Q7TPR4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Actn1Q7TPR4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Actn1Q7TPR4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Actn1Q7TPR4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Actn1Q7TPR4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Actn1Q7TPR4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Actn1Q7TPR4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Actn1Q7TPR4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Actn1Q7TPR4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Actn1Q7TPR4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Actn1Q7TPR4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Actn1Q7TPR4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Actn1Q7TPR4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Actn1Q7TPR4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Actn1Q7TPR4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Actn1Q7TPR4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Actn1Q7TPR4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Actn1Q7TPR4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Actn1Q7TPR4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Actn1Q7TPR4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Actn1Q7TPR4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Actn1Q7TPR4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Actn1Q7TPR4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Actn1Q7TPR4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Actn1Q7TPR4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Actn1Q7TPR4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Actn1Q7TPR4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Actn1Q7TPR4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Actn1Q7TPR4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Actn1Q7TPR4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Actn1Q7TPR4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Actn1Q7TPR4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Actn1Q7TPR4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Actn1Q7TPR4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Actn1Q7TPR4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms