Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sbno2Q7TNB8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sbno2Q7TNB8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sbno2Q7TNB8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sbno2Q7TNB8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sbno2Q7TNB8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sbno2Q7TNB8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sbno2Q7TNB8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sbno2Q7TNB8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sbno2Q7TNB8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sbno2Q7TNB8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Sbno2Q7TNB8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sbno2Q7TNB8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sbno2Q7TNB8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sbno2Q7TNB8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sbno2Q7TNB8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sbno2Q7TNB8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sbno2Q7TNB8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sbno2Q7TNB8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sbno2Q7TNB8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sbno2Q7TNB8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sbno2Q7TNB8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sbno2Q7TNB8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sbno2Q7TNB8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sbno2Q7TNB8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sbno2Q7TNB8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sbno2Q7TNB8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sbno2Q7TNB8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sbno2Q7TNB8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Sbno2Q7TNB8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sbno2Q7TNB8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sbno2Q7TNB8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sbno2Q7TNB8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sbno2Q7TNB8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sbno2Q7TNB8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sbno2Q7TNB8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sbno2Q7TNB8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sbno2Q7TNB8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sbno2Q7TNB8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sbno2Q7TNB8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sbno2Q7TNB8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sbno2Q7TNB8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sbno2Q7TNB8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sbno2Q7TNB8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sbno2Q7TNB8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sbno2Q7TNB8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sbno2Q7TNB8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sbno2Q7TNB8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sbno2Q7TNB8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sbno2Q7TNB8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sbno2Q7TNB8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sbno2Q7TNB8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Sbno2Q7TNB8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sbno2Q7TNB8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sbno2Q7TNB8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sbno2Q7TNB8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sbno2Q7TNB8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sbno2Q7TNB8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sbno2Q7TNB8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sbno2Q7TNB8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbno2Q7TNB8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbno2Q7TNB8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbno2Q7TNB8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sbno2Q7TNB8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sbno2Q7TNB8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sbno2Q7TNB8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sbno2Q7TNB8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sbno2Q7TNB8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sbno2Q7TNB8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sbno2Q7TNB8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sbno2Q7TNB8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sbno2Q7TNB8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sbno2Q7TNB8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sbno2Q7TNB8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sbno2Q7TNB8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sbno2Q7TNB8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sbno2Q7TNB8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sbno2Q7TNB8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sbno2Q7TNB8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sbno2Q7TNB8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sbno2Q7TNB8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sbno2Q7TNB8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms