Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc88cQ6VGS5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc88cQ6VGS5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc88cQ6VGS5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc88cQ6VGS5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc88cQ6VGS5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc88cQ6VGS5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc88cQ6VGS5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc88cQ6VGS5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc88cQ6VGS5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc88cQ6VGS5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc88cQ6VGS5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc88cQ6VGS5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc88cQ6VGS5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc88cQ6VGS5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc88cQ6VGS5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc88cQ6VGS5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc88cQ6VGS5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc88cQ6VGS5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc88cQ6VGS5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc88cQ6VGS5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc88cQ6VGS5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc88cQ6VGS5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc88cQ6VGS5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc88cQ6VGS5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc88cQ6VGS5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc88cQ6VGS5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc88cQ6VGS5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc88cQ6VGS5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc88cQ6VGS5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc88cQ6VGS5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc88cQ6VGS5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc88cQ6VGS5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc88cQ6VGS5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc88cQ6VGS5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc88cQ6VGS5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc88cQ6VGS5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc88cQ6VGS5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc88cQ6VGS5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc88cQ6VGS5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc88cQ6VGS5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc88cQ6VGS5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc88cQ6VGS5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc88cQ6VGS5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc88cQ6VGS5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc88cQ6VGS5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms