Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Flrt1Q6RKD8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Flrt1Q6RKD8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Flrt1Q6RKD8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Flrt1Q6RKD8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Flrt1Q6RKD8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Flrt1Q6RKD8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Flrt1Q6RKD8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Flrt1Q6RKD8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Flrt1Q6RKD8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Flrt1Q6RKD8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Flrt1Q6RKD8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Flrt1Q6RKD8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Flrt1Q6RKD8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Flrt1Q6RKD8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Flrt1Q6RKD8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Flrt1Q6RKD8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Flrt1Q6RKD8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms