Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmaQ6PCX7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmaQ6PCX7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmaQ6PCX7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmaQ6PCX7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmaQ6PCX7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmaQ6PCX7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmaQ6PCX7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgmaQ6PCX7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgmaQ6PCX7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmaQ6PCX7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RgmaQ6PCX7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RgmaQ6PCX7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RgmaQ6PCX7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RgmaQ6PCX7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RgmaQ6PCX7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RgmaQ6PCX7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RgmaQ6PCX7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RgmaQ6PCX7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RgmaQ6PCX7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RgmaQ6PCX7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152 ms