Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Papd7Q6PB75 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Papd7Q6PB75 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Papd7Q6PB75 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Papd7Q6PB75 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Papd7Q6PB75 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Papd7Q6PB75 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Papd7Q6PB75 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Papd7Q6PB75 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Papd7Q6PB75 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Papd7Q6PB75 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Papd7Q6PB75 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Papd7Q6PB75 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Papd7Q6PB75 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Papd7Q6PB75 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Papd7Q6PB75 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Papd7Q6PB75 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Papd7Q6PB75 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Papd7Q6PB75 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Papd7Q6PB75 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Papd7Q6PB75 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Papd7Q6PB75 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Papd7Q6PB75 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Papd7Q6PB75 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Papd7Q6PB75 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Papd7Q6PB75 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Papd7Q6PB75 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Papd7Q6PB75 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Papd7Q6PB75 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Papd7Q6PB75 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Papd7Q6PB75 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Papd7Q6PB75 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Papd7Q6PB75 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Papd7Q6PB75 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Papd7Q6PB75 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Papd7Q6PB75 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Papd7Q6PB75 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Papd7Q6PB75 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Papd7Q6PB75 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Papd7Q6PB75 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Papd7Q6PB75 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Papd7Q6PB75 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Papd7Q6PB75 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Papd7Q6PB75 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms