Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atl2Q6PA06 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atl2Q6PA06 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atl2Q6PA06 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atl2Q6PA06 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atl2Q6PA06 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atl2Q6PA06 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atl2Q6PA06 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atl2Q6PA06 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atl2Q6PA06 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atl2Q6PA06 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atl2Q6PA06 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atl2Q6PA06 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atl2Q6PA06 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atl2Q6PA06 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atl2Q6PA06 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atl2Q6PA06 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atl2Q6PA06 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atl2Q6PA06 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atl2Q6PA06 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atl2Q6PA06 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atl2Q6PA06 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atl2Q6PA06 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atl2Q6PA06 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atl2Q6PA06 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Atl2Q6PA06 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atl2Q6PA06 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atl2Q6PA06 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atl2Q6PA06 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atl2Q6PA06 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atl2Q6PA06 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atl2Q6PA06 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atl2Q6PA06 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atl2Q6PA06 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atl2Q6PA06 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atl2Q6PA06 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atl2Q6PA06 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atl2Q6PA06 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atl2Q6PA06 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atl2Q6PA06 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atl2Q6PA06 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atl2Q6PA06 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atl2Q6PA06 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atl2Q6PA06 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atl2Q6PA06 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atl2Q6PA06 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms